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冲方丁の日本SF大賞受賞作を元にした劇場版アニメ3部作の第1弾。緊急法令”マルドゥック・スクランブル-09″により命を救われた少女娼婦・バロット。彼女は自分を亡き者にしようとした男の犯罪を暴こうと立ち上がる。
それは、彼女の選択―。第24回日本SF大賞を受賞した冲方丁原作小説『マルドゥック・スクランブル』シリーズを劇場アニメ化!シリーズ全3部作の第2弾「マルドゥック・スクランブル 燃焼」を収録。
冲方丁の日本SF大賞受賞作を元にした劇場版アニメ3部作の完結編。シェルの犯罪に巻き込まれた少女娼婦・バロットと委任事件担当官のウフコックは、シェルの移し替えられた記憶は彼が経営するカジノの百万ドルチップの中に隠されていることを知り.。